باغ چهلستون از جمله باغهای وسیعی است که در دوره ی سلطنت شاه عباس اول (996-1038 هجری) در اصفهان احداث شده است ولی بیشتر ساختمان ها و تالارهای بزرگ و کوچک آن از آثار دوره سلطنت شاه عباس دوم هفتمین پادشاه از سلسله ی صفویه است که محل بارعام و کاخ پذیرایی رسمی آن پادشاه بوده است. به موجب یک کتیبه ی تاریخی که در سال 1327 خورشیدی در جبهه ی تالار عمارت چهلستون از زیر گچ خارج شد کاخ چهلستون در پنجمین سال سلطنت شاه عباس دوم در سال 1057 هجری باتمام رسیده است و صائب ملک الشعرای دربار شاه عباس دوم طی قصیده ای بلند مراحل ساخت و اتمام این بنا را به رشته-ی نظم کشیده است.
وجه تسمیه چهلستون به علت تعدد ستون های این کاخ است که در ایران تعدد و کثرت را بیشتر با عدد چهل بیان می کنند اما تصادفاً چون تعداد ستون های تالار چهلستون بیست عدد است و انعکاس عمارت و ستونهای تالار در استخر روبه روی عمارت نیز بیست عدد است مفهموم چهلسون پیدا می کند. هر یک از ستونهای بیست گانه تالار از یک تنه درخت چنار تشکیل شده است که سابقاً با آینه و شیشه های رنگی پوشانده شده بود. تمام دیوارهای کاخ از آیینه های قدی و شیشه های رنگی و نقاشیهای زیبا تزیین شده بود و همه ی درها و پنجره ها از نوع منبت و خاتم بوده است. دیوارها تا نیمه از سنگ مرمر سفید و نیمی دیگر از آیئنه و شیشه های رنگارنگ پوشیده است. در مهرماه سال 1327این بنا به موزه تغییر کاربری داد. این موزه از لحاظ قدمت بعد از کاخ گلستان دومین موزه ایران به شمار می رود. ضمن تعمیراتی که در سال 1335 خورشیدی انجام شد برای مدتی اشیا موزه به محل دیگری انتقال داده شد. در مراحل مرمت بنا در سه اتاق کاخ چهلستون نقاشی هایی از زیر گچ خارج شد که بسیار جلب توجه کرد در یکی از این اتاق ها مجلس بزرگ شاهانه با دوازده تصویر مینیاتوری از شاه عباس کبیر با تاج مخصوص و تصویرها و مینیاتورها و نقاشی های گل و بوته طلائی از آثار قابل ملاحظه و به قلم رضا عباسی نقاش هنرمند معروف شاه عباس به دست آمده است. و سرانجام در سال 1367 بار دیگر کاخ چهلستون به موزه تبدیل شد. در این موزه نسخ خطی، نگارگری و ظروف کاربردی و تزیینی متعلق به دوران اسلامی خصوصاً صفویه به نمایش گذارده شده است و نمایشگاه های ادواری به مناسبت های مختلف برگزار می شود. مجموعه های کاخ موزه چهلستون عبارتند از مجموعه سفال از اولین نمونه کاشی های ساخت اصفهان، مجموعه های آبگینه، فرش، نسخ خطی کوفی قرآن، مجموعه سکه های ماقبل تاریخ، انواع قباله های ازدواج قرن نهم تا پایان دوران قاجار و انواع سنگ نوشته ها.